প্রশাসনে সচিব পদে আরও পরিবর্তন আসছে। আওয়ামীলীগ সরকারের আমলে নিয়োগ পাওয়া বড় বড় ক্ষমতাধর কর্মকর্তারা বিভিন্ন মন্ত্রণালয়ে সচিব পদে রয়েছেন তাদের প্রত্যাহার ও নতুন সচিব নিয়োগ দিয়ে পদায়ন করতে প্রধান উপদেষ্টার কার্যালয় কাঠোর নির্দেশনা দেয়া হয়েছে। ইতোমধ্যে সাবেক প্রধানমন্ত্রীর মূখ্য সচিবের চুক্তি বাতিল এবং প্রধানমন্ত্রীর কাযালয়ের সচিবসহ বেশ কয়েকজনকে ওএসডি এবং বরখাস্ত আবার সাবেক জননিরাপ্তা বিভাগের সচিবকে গ্রেফতার করা হয়েছে। ৪০০ কোটি টাকা দুর্নীতির ঘটনায় স্থানীয় সরকার বিভাগের সচিব ও আইডিয়াল স্কুল অ্যান্ড কলেজের পরিচালনা পর্ষদের সাবেক সভাপতি আবু হেনা মোরশেদ জামান, জ্বালানি ও খনিজ সম্পদ বিভাগ সচিব মো.নূরুল আলম, দুর্যোগ ব্যবস্থাপনা ও ত্রাণ মন্ত্রণালয়ের সচিব মো.কামরুল হাসানসহ আওয়ামীলীগের আমলে নিয়োগ পাওয়া সচিবদের প্রত্যাহার করা হচ্ছে। তবে দলবাজ ও দুর্নীতিবাজ সচিবদের প্রথমে ওএসডি পরে মামলা করা এবং গোয়েন্দা নজরদারীতে রাখা হতে পারে বলে জনপ্রশাস মন্ত্রণালয় সূত্রে এ তথ্য নিশ্চিত করা হয়েছে।